Chakra(ãƒãƒ£ã‚¯ãƒ©,chakura)
Sangat penting bagi seorang ninja, bahkan ini adalah jutsu paling dasar, yang merupakan campuran dari energi fisik (身体エãƒãƒ«ã‚®ãƒ¼,shintai enerugÄ«) yang hadir dalam setiap sel tubuh dan energi spiritual (精神エãƒãƒ«ã‚®ãƒ¼,seishin enerugÄ«) yang diperoleh dari latihan dan pengalaman bertarung.
Setelah tercampur, energi dapat disalurkan melalui sistem peredaran darah chakra di setiap 361 titik peredaran chakra (disebut tenketsu) dalam tubuh. Melalui berbagai metode, yang paling umum digunakan adalah setiap ninja adalah segel tangan, chakra kemudian dapat dimanipulasi untuk menciptakan efek yang tidak akan mungkin dimengerti, seperti : berjalan di atas air, menghembuskan napas api atau menciptakan ilusi. Dengan rasio pencampuran yang berbeda dari dua energi tersebut, sehingga dapat melakukan brbgai teknik baru.
Unsur yang paling umum bagi seorang ninja adalah unsur cakra, yang dapat digunakan untuk melakukan teknik element jutsu.
biasanya seorang ninja memiliki afinitas yang alami untuk satu jenis chakra saja, tetapi mereka juga biasanya memiliki kemampuan untuk menciptakan chakra unsur tambahan terlepas dari afinitas mereka sendiri.
Ada enam dasar tipe elemen chakra , masing-masing punya kekuatan unggulan dan lemah terhadap elemen yang lain, kelima element sangat sering ditunjukkan sejauh ini, namun hubungan mereka, kelemahan, dan kekuatan satu sama lain semuanya dieksplorasi, berurusan dengan elemen keenam yaitu Yin dan Yang dan keseimbangan energi fisik dan mental.
Selain enam unsur tersebut, tertentu kekkei genkai juga dapat mencampur chakra elemen untuk membentuk elemen baru, misalnya akan mungkin untuk seorang ninja mencampur air dan angin menjadi es.
Sementara banyak ninja dapat menggunakan lebih dari satu jenis chakra, dan sangat sedikit juga ninja yang mampu menggunakannya dua element secara bersamaan ntuk menciptakan element baru.